Sulawesi adalah salah satu simpul terpenting dalam jaringan kapal penumpang Indonesia timur. Makassar menjadi pelabuhan besar untuk rute PELNI menuju Jawa, Maluku, Papua dan Kalimantan. Untuk penyeberangan kendaraan, jalur Bajoe–Kolaka dan Bira–Pamatata menghubungkan wilayah Sulawesi dengan pulau-pulau di sekitarnya. Lihat juga Kalimantan, Papua dan Nusa Tenggara untuk jaringan regional yang lebih luas.
